Trận tứ kết đầu tiên là cuộc chạm trán giữa hai đại diện phía Nam, ĐH Sư phạm TDTT TP.HCM và ĐH Công nghiệp TP.HCM. Với vị trí nhất bảng A, thầy trò HLV Phạm Thái Vinh luôn thể hiện trình độ vượt trội với lối chơi pressing ở tầm cao liên tục. Sau hơn nửa thời gian ở hiệp 1, ĐH Sư phạm TDTT TP.HCM vượt lên chiếm ưu thế bằng bàn thắng dẫn trước ở phút 20 của Lê Trường Thọ. Bước sang hiệp hai, ĐH Công Nghiệp TP.HCM dồn lên tấn công tổng lực tuy nhiên các cơ hội đều bị bỏ lỡ. Phía bên kia, Đại học Sư phạm TDTT TP.HCM không tốn quá nhiều sức lực nhưng vẫn bảo toàn được tỷ số 1-0 để giành tấm vé đầu tiên vào bán kết.

Tiếp theo sau là trận đấu tâm điểm của tứ kết giữa 2 ứng cử viên vô địch, trường ĐH Sư phạm TDTT Hà Nội và trường ĐH Sư phạm Hà Nội. Cục diện trận đấu sớm định đoạt ngay giữa hiệp 1 khi ở phút 25, Vũ Việt Hoàng ghi điểm cho đội ĐH Sư phạm TDTT Hà Nội bằng một cú sút đẹp mắt. Trong hiệp 2, ĐH Sư phạm Hà Nội rất nỗ lực tìm kiếm bàn thắng. Tuy vậy, các chân sút đều không thể chuyển hoá các cơ hội thành bàn thắng và phải ngậm ngùi nhìn tấm vé vào bán kết được trao cho ĐH Sư phạm TDTT Hà Nội.

Mở đầu buổi chiều là trận đấu giữa Đại học Huế và Đại học Nông Lâm TP.HCM. Ngay từ tiếng còi khai cuộc, cổ động viên liên tục được thưởng thức những đường lên bóng với nhịp độ nhanh từ 2 đội bóng. Tuy vậy, chưa có cơ hội nào thực sự rõ rệt để chuyển hóa thành bàn thắng. Sang hiệp đấu thứ 2, Đại học Huế vẫn duy trì nhịp tấn công trong khi Đại học Nông Lâm TP.HCM chuyển về lối chơi phòng ngự phản công. Hai đội bước vào loạt luân lưu sau 2 hiệp đấu không có bàn thắng nào được ghi. Tại đây, thủ môn Lê Minh Chiến của Đại học Nông Lâm TP.HCM xuất sắc cản phá hai quả penalty, chính thức loại ĐH Huế ra khỏi cuộc chơi.

Ở trận tứ kết cuối cùng, khó khăn càng chồng chất khó khăn với Đại học FPT. Họ không may mất đi sự ưu tiên hàng đầu trong khung gỗ vì chấn thương của thủ thành trong những phút đầu trận. Tận dụng lợi thế tâm lý, trường Đại học Thuỷ lợi liên tục dồn ép và cuối cùng có được thành quả. Lần lượt ở các phút 30, 49 và 79. các tay săn bàn của Thủy lợi đem về 3 bàn thắng và 3-0 là tỷ số cuối cùng của trận đấu này.

Như vậy, 4 đội bóng bước vào bán kết giải vô địch bóng đá sinh viên toàn quốc – SV Cup 2023 là Đại học Sư phạm TDTT TP.HCM - Đại học Sư phạm TDTT Hà Nội và Đại học Nông Lâm TP.HCM - Đại học Thuỷ lợi.